一、关于管辖
对于多人实施的有关联的环境污染刑事犯罪案件，并案处理有利于查明案件事实的，按照最高人民法院、最高人民检察院、公安部、国家安全部、司法部、全国人大常委会法制工作委员会《关于实施刑事诉讼法若干问题的规定》，人民法院、人民检察院、公安机关可以在其职责范围内并案处理。
二、关于打击重点
办理环境污染刑事案件，对违反国家规定排放、倾倒、处置有毒有害物质严重污染环境的企业、个体经营户等，要将主要获利者作为重点打击对象；对于在生产经营中起到监督、管理作用的工作人员和直接排放、倾倒、处置污染物的工作人员，可以按照“直接负责的主管人员和其他直接责任人员”定罪处罚；对于其他操作人员或普通执行人员等，要分清责任，除情节恶劣外，一般不予定罪处罚。
对符合逮捕条件的重点打击人员，一般应允以批准逮捕，对已被批准逮捕的人员，一般不予改变强制措施、不判处缓刑。
三、关于几个问题的认定
1、主观故意的认定。明知包括知道或者应当知道。污染防治设施以及其他生产设备发生故障，发现后放任污染物排放的，以“明知”论处。
具有下列情形之一，并且犯罪嫌疑人、被告人不能作出合理解释的，可以认定其“应当知道”，但有证据证明确系不知情的除外：（1）根据其生产工艺、生产流程必然会产生污染物，但没有处理、净化设备，或者虽然有这些设备但没有开启的；（2）污染防治设施以及其他生产设备发生故障，在故障发生后的合理时限内未处置的；（3）上下家涉嫌共同犯罪的，知道下家无资质处理、无经营许可证或超出经营许可证范围，且支付的处理费用明显低于市场价的。
2、对企业产生物质属性变更的认定。对企业未按照环境影响评价报告中的生产工艺组织生产，或者擅自改变生产过程中的原辅材料，其产生的物品属性不能按照原环境影响评价报告进行直接认定，应当重新进行鉴别。
3、“污染物排放标准三倍以上”的认定。是指超过污染物排放标准的三倍，即污染物排放标准×3以上的浓度，如标准为0.5的，超过1.5即为超标。
4、“私设暗管”的认定。未经职能部门审批安装、规避监管的排放管道均属《解释》第一条第四项中“暗管”；利用隐蔽时段或隐蔽地点非法排放，属于广义上的以“私设暗管”形式排放。
5、“公私财产损失”的认定。“公私财产损失”包括污染环境行为直接造成财产毁损、减少的实际价值，以及为防止污染扩大、消除污染而采取必要合理措施所产生的费用，不包括环境修复费用和鉴定、评估费用。对有可能适用《解释》第一条、第三条“致使公私财产损失三十万元（或者一百万元）以上的”条款的环境污染刑事案件，必须提供“环境污染损害（鉴定）评估报告”。
6、“重金属”的认定。《解释》第十条中的重金属范围，除了条文中明确列举的铅、汞、镉、铬之外，其他的重金属可参照国务院《重金属污染综合防治“十二五”规划》和《浙江省重金属污染综合防治规划（2010-2015）》来把握。
四、关于规范环保取证
由省环保厅在征求省公、检、法三家意见的基础上，尽快制定检材的取证主体、取证地点、取证程序、送检报告的出具以及向公安机关移送案件等具体操作规范。环保部门出具的检验报告或监测报告，应列明毒物、废物、污染物的具体种属，并就检材中是否含有“有毒物质”、“危险废物”或者“一般污染物”等作出结论性论断。但对列入《国家危险废物名录》、《医疗废物分类目录》的废物，可由环保部门依目录直接认定，并出具书面意见。
五、关于溯及力
对于2011年5月1日以后，2013年6月18日《解释》生效前的污染环境行为，除情节十分严重、性质非常恶劣的案件外，只有行为同时符合2006年7月最高人法院《关于审理环境污染刑事案件具体应用法律若干问题的解释》的，才宜根据《解释》作刑事追究。如果行为一直延续到《解释》生效后，可直接适用《解释》规定。
浙江省高级人民法院、浙江省人民检察院、浙江省公安厅、浙江省环境保护厅关于办理环境污染刑事案件若干问题的会议纪要（二）
一、明确私设暗管类案件的调查要点
环保部门在调查过程中发现“私设暗管或者利用渗井、渗坑、裂隙、溶洞等排放、倾倒、处置有放射性的废物、含传染病病原体的废物、有毒物质的”等涉嫌环境污染犯罪的，应严格按照《浙江省涉嫌环境污染违法案件调查取证工作规程》执行，做好现场排污量核实、污染情况描述等前期调查取证工作。
二、应急处置费用应计入“公私财产损失”范畴
应急处置费用属于“为防止污染扩大、消除污染而采取必要合理措施所产生的费用”范畴，应当计入“公私财产损失”。
三、关于涉及废气排放的环境违法行为的查处
对非法熔炼、非法拆解、露天焚烧工业垃圾等环境违法行为所产生的污染物，造成的环境危害，可由环境保护部门组织相关鉴定机构、技术部门出具此类违法行为排放的污染物类型、数量或造成环境危害程度的核算标准；环境保护部门现场调查时，根据现场发现的焚烧、熔炼固体残留物或者拆解物品的种类、数量，参照相关核算标准，给出排放的污染物的类型、数量或造成环境危害程度的鉴定意见，如有必要，可由公安机关组织有关专家进行侦查实验，环保部门应当予以配合。
